Bygningen blev tegnet af den mexicanske arkitekt Michel Rojkind, som oprindeligt blev bedt af ejerne om at designe en overdækket gangbro mellem produktionsbygningerne for besøgende på fabrikken.
Men Rohkind foreslog at bygge et helt museum der (dog af en langstrakt plan og udførte en forbindelsesfunktion). Nu, før de ser produktionen af chokolade med egne øjne, vil tilskuere, for det meste børn, være i stand til at lytte til historien om dette vidunderlige produkt i et lille auditorium og derefter besøge museumsbutikken. Derefter går de gennem en lang tunnel til fabriksværkstedet.
Bygning med et areal på 634 kvm. m når 300 m i længden og bøjer sig gennem det industrielle kompleks, som et stort lyst rødt monster. Arkitekten sammenligner det selv med en origami papirskulptur, et rumskib eller en "halbriha" - en fantastisk skabning af mexicansk folklore. Indvendigt er de fleste af værelserne helt hvide med undtagelse af "teatret" med grønne tæpper på gulve og chokoladebar.
Museet blev designet og bygget på kun to og en halv måned; for dette måtte arkitekter og arbejdere arbejde døgnet rundt og opdele hver dag i tre otte timers skift.
