Butikken ligger i Brurenkerk - det Dominikanske klosters tempel, bygget i det 15. århundrede. Selvom bygningen er ophørt med at være en kirke, er den fortsat et værdifuldt historisk monument, derfor kan alle "innovationer" i forbindelse med boghandelen til enhver tid skilles ad uden at berøre dens bevarelse.
Butiksarealet på ca. 700 m2 ligger hovedsageligt i sideskibet. Derfor opfattes kirkens hovedrum, det centrale skib, stadig som en enkelt helhed - med et orgel fra 1821 på østvæggen og et farvet glasvindue designet af den norske kunstner Kjell Nupen fra vest. Imidlertid fandt de også kommerciel brug: Butikken Waanders In de Broeren er et moderigtigt sted, så der sælges ikke kun bøger der, men der er også en café-madlavning, som blev oprettet i koret.
For at matche tonen i det historiske interiør begrænsede arkitekterne farveskemaet til tre nuancer af træ og hvidt gips. En sådan tilbageholdenhed tjener også handelsinteresser ved at fremhæve farverige bøger og magasiner.
Tre etager blev indbygget i sideskibet, så arkitekterne forsøgte at løse den sædvanlige opgave for butikker i flere etager - for at lokke kunder til toppen. For at gøre dette stiger en blid todelt trappe parallelt med 11 meter reoler, derfor opfattes den ikke engang af besøgende som et cirkulationsrum. Ovenpå venter en belønning på dem: et udstillingsområde under selve buerne, som for første gang kan ses tæt på uden at klatre op på stilladset.
