Museet, der indeholder de berømte tvillingeskærme "Irises" af kunstneren Ogata Korin fra det 17. århundrede samt en række malerier, skulpturer og kunst og kunsthåndværk fra Japan, Kina og Korea, ligger på et tidligere bymands territorium nær den travle Omotesando Boulevard.
Formålet med genopbygningen var at skabe en følelse af "wa" - "japansk harmoni" for den besøgende. Kumas praktiske opgave var at bevare kompleksets afsondrede, lukkede karakter og samtidig følge principperne for japansk arkitektur. Det resulterende projekt kombinerer de enkelte elementer og generelle principper for traditionel arkitektur med modernismens sprog, hvilket forenklede og typificerede detaljer og former.
Bygningen under et tungt tagtag med fremhævede lodrette understøtninger, erhvervede næsten udelukkende glasvægge - dette er både en hyldest til det 21. århundrede og en afspejling af "permeabiliteten" i et traditionelt japansk hus, dets tætte forbindelse med den omgivende natur (i dette tilfælde med haven). Bambus bruges i vid udstrækning - fra ydervægge og lofter til bænke og skabe i opbevaringsrummet.
Hvis hovedbygningen blev rekonstrueret og fordoblet i størrelse, blev museumscaféen fuldstændig genopbygget. I denne lille bygning brugte Kuma glas og olieret papir som hovedmaterialerne og genforenede modernitet og tradition.
