Virksomheden er beliggende i en af sektionerne i High Line-overgangen. Den mørke galvaniserede stålfacade afslører en lav bue trukket af et orange gardin - dette er indgangen til restauranten. Interiøret er domineret af den rå beton, der er typisk for Ando-projekter, men i dette tilfælde er det blødgjort af forhæng af hvidt glasfiber, der dækker loftet.
Sushi-baren og hovedrestauranten er grupperet omkring trappen, der fører til baren på underetagen. I midten af trappen er der en installation af 17.400 flasker fyldt med vand, hver med en LED.
Da det oprindelige rum, hvor restauranten ligger, blev brugt som en læsnings- og losningsplatform, tog det meget tid og kræfter at genopbygge, hvilket til sidst kostede $ 12 millioner. Morimoto ejes af den berømte restauratør Stephen Starr, hvis andre virksomheder er designet af designere som Karim Rashid og David Rockwell.
Restauranten er opkaldt efter sin kok, Masaharu Morimoto, som er ekstremt populær i USA.