Hovedudstillingen om temaet "Byer, arkitektur og samfund" kombineres i år med udstillingen "Byer af sten" i Venedig og udstillingen "Havneby" i Palermo.
Nyt i år afholdes den største prisoverrækkelse i slutningen af biënnalen den 8. november 2006. Samtidig bliver prisvinderne af Stone Lion-prisen - hovedsageligt den venetianske sektion og Portus arkitektpris - i Palermo-sektionen hædret. På åbningsdagen den 10. september modtager kun Richard Rogers den gyldne løve for vigtigt bidrag til udviklingen af arkitektur …
Biennalens partner i år er Risanamento SpA, som bygger i Milano nye områder i Santa Giulia (arkitekt Norman Foster) og den tidligere Falk-industrizone (arkitekt Renzo Piano). Hun vil præsentere sin udstilling i Venedig dedikeret til disse projekter. Udstillingen understøttes også af firmaerne "Inarcassa" og "illycaffè". Targetti-firmaet har i samarbejde med Biennalen installeret et kreativt belysningssystem til den italienske pavillon, nogle andre udstillingsrum i Venedig og alle udstillinger i Palermo.
